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BioSense微生物快速立體計數(shù)儀

丹麥BioSense公司μCount3D微生物立體計數(shù)儀能在8分鐘內(nèi)對液體樣品中純培養(yǎng)的細菌、真菌孢子、酵母、微藻進行計數(shù)。

μCount3D微生物立體計數(shù)儀,使用帶有三個樣品室的測量板,Count3D軟件展示總細菌/mL或真菌孢子/mL,并記錄圖像。

丹麥BioSense公司擁有全世界領先的傾斜倒置成像技術和機器視覺算法,專有的FluidScope傾斜攝像頭掃描技術提供精確和可重復的結果。

FluidScope傾斜攝像頭掃描技術原理:當拍攝圖像時,拍攝的是一個體積而不是一個平面。每個圖像的高度為150 μm,由于圖像重疊,我們可以創(chuàng)建垂直和水平的Z堆棧。此體積中存在的所有對象都被聚焦捕獲。

技術參數(shù)

1 樣品種類:細菌、真菌、酵母、藻類。

2 儀器尺寸:長20cm×寬10cm×高20cm。

3 樣品大小:0.5μm以上。

4 可計數(shù)范圍:1×104?– 1×107

5 運行時間:8 min。

6 實驗數(shù)據(jù)格式:個/mL、圖片、PDF報告。

7 樣品容器:BioSense三格樣品板。

8 可自設算法。

真菌孢子和細菌的計數(shù)

為了計數(shù)真菌孢子,我們使用深度學習算法來識別和計數(shù)樣本中的孢子。計數(shù)算法廣泛應用于我們的oCelloScope?活細胞成像技術,并用于醫(yī)學、農(nóng)作物科學和食品研發(fā)。我們支持一系列孢子和形態(tài),甚至為科學家提供注釋工具來創(chuàng)建自己的算法。

對于細菌計數(shù),我們使用體積成像法來計數(shù)整個體積中存在的細菌。細菌沉降非常緩慢,并且存在于整個成像體積中。因此我們可以捕獲所有細菌,可測量細菌小至0.5 μm像素。

1 μm質(zhì)控微珠的線性響應

圖1 用μCount3D立體計數(shù)儀測量2倍稀釋的1 μm質(zhì)控微珠的線性響應,R2=0.9992。線性響應是評估計數(shù)系統(tǒng)性能的關鍵參數(shù),它指的是計數(shù)系統(tǒng)在特定濃度范圍內(nèi)產(chǎn)生與實際數(shù)量成正比的結果的能力。

圖1左圖顯示整個范圍1.6×104–2×106,圖1右圖顯示縮放范圍1.6×104-3×105

芽孢桿菌孢子的線性響應

圖2 使用μCount3D立體計數(shù)儀測量2倍稀釋的3種不同芽孢桿菌孢子(枯草芽孢桿菌,2種平行芽孢桿菌菌株)的商業(yè)殺線蟲劑產(chǎn)品的線性響應,R2=0.9972。

圖2左圖顯示整個范圍2.3×104-1.2×107,圖2右圖顯示縮放范圍2.3×104到7.5×105

μCount3D立體計數(shù)儀與瓊脂上的菌落計數(shù)的對比

我們建立了一個驗證測試,使用μCount3D立體計數(shù)儀和瓊脂菌落培養(yǎng)計數(shù)來測量大腸桿菌。為了精確菌落計數(shù),我們使用IntuGrow快速CFU/mL測定法(IntuBio,F(xiàn)arum,Denmark,www.IntuBio.dk)。

方案:大腸桿菌(K12)在TSB中生長過夜。使用0.2 μm過濾器對10 mL 0.9%NaCl緩沖液進行無菌過濾,以去除緩沖液中的顆粒。一夜之間,大腸桿菌在Eppendorf管中稀釋100倍,達到所需的起始濃度約1×107。使用μCassetteB,65 μL/室(BioSense Solutions,F(xiàn)arum,Denmark)測量大腸桿菌濃度,一式三份。使用μCount3D算法:細菌。實驗起始濃度測量為6.97×106,樣品離心管標記為“1”。對于IntuGrow平板計數(shù),將試管“1”進一步稀釋,以達到預期的20-100個菌落計數(shù)。對于平板計數(shù),將10 μL稀釋的樣品“1”用TSA在迷你瓊脂盤(丹麥法魯姆BioSense Solutions)上一式三份。將迷你瓊脂盤放置在12孔微量滴定板中,使用oCelloScope?對瓊脂表面進行成像。使用IntuGrow軟件(IntuBio,F(xiàn)arum,Denmark)對新出現(xiàn)的菌落進行計數(shù)。從原始試管“1”中,制備了含有500 μL 0.9%NaCl和500 μL樣品的2倍稀釋系列。將帶試管的架子置于寒冷條件下,以減少大腸桿菌的新分裂。總共進行了8×2倍的稀釋。重復試管“1”的程序,對所有樣品進行計數(shù),一式三份。

結論:μCount3D立體計數(shù)儀和平板計數(shù)之間的比較測試顯示出非常好的相關性。實驗進行了4次,相關性相等。在所有實驗中,平板計數(shù)略高于μCount3D立體計數(shù)儀的計數(shù)。我們推測這種差異可能是由移液引起的,因為μCount3D立體計數(shù)儀使用的樣品直接來自稀釋樣品管,而用于平板計數(shù)的樣品會進一步稀釋100-1000倍,并從中接種10 μL瓊脂,所以移液管的不準確性可能是造成差異的原因。

圖3, TSB中過夜2倍稀釋的大腸桿菌培養(yǎng)物。藍線表示使用μCount3D立體計數(shù)儀的自動計數(shù)。橙色線表示使用瓊脂平板測定法在TSA上的菌落計數(shù)。圖3線性響應為R2=0.987。

圖4, μCount3D立體計數(shù)儀計數(shù)結果與TSA菌落平板計數(shù)結果的相關性。與圖3中使用的數(shù)據(jù)相同。圖4線性響應為R2=0.991。

圖5, μCount3D立體計數(shù)儀的軟件視圖,顯示了實驗中使用的大腸桿菌的三孔讀數(shù)。

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