產(chǎn)單核細(xì)胞李氏桿菌噬菌體分離、超離、宿主譜鑒定及生長曲線繪制（二）
2結(jié)果
2.1產(chǎn)單核細(xì)胞李氏桿菌噬菌體的分離
利用本實(shí)驗(yàn)室保存的產(chǎn)單核細(xì)胞李氏桿菌作為宿主菌，對采集的所有污水樣品利用雙瓊脂平板法進(jìn)行分離，分離出若干株噬菌體，選取一株性狀優(yōu)良、傳代穩(wěn)定的噬菌體進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)，并命名為LP8，宿主菌編號為ATCC19111(1/2a)，平板上可以觀察到明顯的噬菌斑，噬菌斑形狀規(guī)整，邊緣整齊，顏色透亮，直徑2 mm左右，純化傳代穩(wěn)定，無暈環(huán)(圖1)。
2.2噬菌體超離
利用氯化銫密度梯度離心法對LP8噬菌體濃縮液進(jìn)行超離，在密度為1.50～1.70 g·mL的氯化銫溶液梯度之間具有噬菌體層，吸取噬菌體超離液，通過效價(jià)核定，效價(jià)為4.4×10PFU·mL。
2.3噬菌體電鏡觀察
利用透射電鏡對LP8樣品進(jìn)行觀察，發(fā)現(xiàn)LP8為肌尾科噬菌體，具有標(biāo)準(zhǔn)的20面體的頭部，還有一個(gè)由中空的針狀結(jié)構(gòu)和鞘組成的尾部，以及尾針組成的基部，噬菌體的頭部直徑約為80 nm；尾部長度約為120 nm(圖2)。
2.4 LP8噬菌體效價(jià)的測定
對LP8噬菌體的裂解液、濃縮液、超離液進(jìn)行效價(jià)測定，結(jié)果分別為1.76×10、2.67×10、4.4×10PFU·mL。
2.5 LP8噬菌體宿主譜鑒定
利用實(shí)驗(yàn)室所保存的產(chǎn)單核細(xì)胞李氏桿菌、威爾斯李氏桿菌和英諾克李氏桿菌對LP8噬菌體進(jìn)行宿主譜鑒定，結(jié)果顯示LP8噬菌體對18株LM都具有裂解性，對5株威爾斯李氏桿菌(C10、9-2、4-40、C59、4-43)具有裂解性，對22株英諾克李氏桿菌均無裂解性(表1)。
表1 LP8噬菌體宿主譜
2.6 LP8噬菌體生長特性
對LP8設(shè)置不同的感染比例，測定出LP8的MOI為1(圖3A)；設(shè)置25、35、45、55、65、75℃溫度梯度，確定LP8的最適溫度為45℃(圖3B)；設(shè)置pH為2、4、6、7、8、10、12梯度，確定LP8的最適pH為7(圖3C)；采用的6種有機(jī)溶劑中，氯仿和異戊醇對LP8影響最大，可造成LP8全部失活，丙三醇和SM空白對照組沒有影響，甲醇和乙醇會(huì)導(dǎo)致噬菌體部分失活(圖3D)；繪制一步生長曲線，確定LP8潛伏期為23 min，對數(shù)期為23～80 min，80 min以后達(dá)到平臺(tái)期，噬菌體效價(jià)最大可達(dá)到3.4×10PFU·mL(圖3E)。
A.最佳感染復(fù)數(shù)；B.溫度影響；C.pH影響；D.有機(jī)溶劑影響；E.一步生長曲線
2.7 LP8基因組酶切鑒定
電泳條帶顯示，噬菌體LP8基因組在1、2號DNA酶泳道未出現(xiàn)條帶，在3、4號RNA泳道和5、6號綠豆核酸酶泳道都出現(xiàn)了條帶，根據(jù)條帶結(jié)果得出噬菌體基因組為雙鏈DNA(圖4)。
M.15000 DNA相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)；1、2.DNase I；3、4.RNase I；5、6.綠豆核酸酶
2.8 LP8基因組測序
經(jīng)測序，噬菌體LP8的基因組為87 038 bp，共有120個(gè)編碼基因，編碼基因的累加長度為76 326 bp、編碼基因的平均長度為636 bp、編碼區(qū)域長度占基因組的比例為87.69%。通過SnapGene軟件對全基因組進(jìn)行繪圖，分析其基因的大小和分布情況。通過COG、KEGG、GO對LP8的基因進(jìn)行注釋，發(fā)現(xiàn)有6個(gè)編碼基因參與原噬菌體合成；有20個(gè)編碼基因參與噬菌體有關(guān)的生物過程；11個(gè)編碼基因參與分子功能，如結(jié)合或催化；8個(gè)編碼基因參與噬菌體的合成，具體生物學(xué)通路最多的為嘌呤代謝和嘧啶代謝(圖5)。
圖5 LP8噬菌體基因組
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