高效萘降解菌N-3生長曲線、脫氫酶活性的測定——摘要、實驗部分
從柴油污染土壤中篩選分離出一株萘降解菌N-3，進行了菌種鑒定及萘雙加氧酶基因（nah）驗證，并考察了該菌對不同種類多環芳烴（PAHs）的降解能力及降解過程中脫氫酶活性的變化。實驗結果表明：該菌為銅綠假單胞菌（Pseudomonas aeruginosa），含有nah基因；當分別對液體培養基中質量濃度為50 mg/L的萘、菲、蒽、芘、芴降解84 h時，菌株N-3對萘、菲、蒽、芘、芴的降解率分別為28.81%，34.83%，36.65%，27.50%，23.47%。菌株N-3的脫氫酶活性與其對不同PAHs的降解率呈一定的正相關性。該菌不僅能有效降解萘，且對其他種類PAHs也有一定降解作用。
多環芳烴（PAHs）是一類含有兩個或兩個以上苯環的芳香族化合物。近年來，隨著人類生產活動的加劇，環境中的PAHs大量增加。由于PAHs具有疏水性強、相對分子質量高、穩定性好、毒性大、難降解、在環境中存在時間長、具有潛在致癌性等特點，被很多國家列為優先控制污染物。土壤中的PAHs主要來源于污水灌溉、大氣沉降和工業滲漏等。PAHs被土壤粒子吸附后，可經農作物富集而進入食物鏈，威脅人類健康。此外，土壤中的PAHs還可進入大氣和水體，造成二次污染。目前，微生物法是降解PAHs最有效的方法之一。該法通過微生物的生長代謝等過程將有毒、難降解的有機物轉化成無毒無害的化合物，安全經濟且對環境無二次污染。近年來已有多名學者分離篩選出不同種類的萘、菲、蒽、芘、芴等PAHs的降解菌。
本工作從柴油污染土壤中篩選、分離出一株高效萘降解菌N-3，對其進行了菌種鑒定及PCR擴增實驗，并考察了該菌株對單一萘、菲、蒽、芘、芴的降解能力及降解過程中脫氫酶活性的變化。
1實驗部分
1.1試劑、材料和儀器
萘、菲、蒽、芘、芴、氯化三苯基四氮唑（TTC）：純度均為99%，Sigma-Aldrich公司；正己烷：分析純；葡萄糖：純度為97%。
Tris-HCl緩沖溶液：三羥甲基氨基甲烷濃度為0.05 mol/L，pH=7.19。
土樣：取自某市的柴油污染土壤。
LB培養基：蛋白胨10.0 g，酵母粉5.0 g，NaCl 10.0 g，蒸餾水1 000 mL，pH=7.0，121℃滅菌15 min，保存備用。
無機鹽培養基：KH2PO41.0 g，K2HPO41.0 g，NH4NO31.0 g，MgSO40.5 g，CaCl20.01 g，FeSO4·7H2O 0.1 g，蒸餾水1 000 mL，pH=7.0，121℃滅菌15 min，保存備用。
萘選擇性培養基及PAHs降解培養基：分別用正己烷配制萘、菲、蒽、芘、芴質量濃度為1 g/L的有機溶液，過濾除菌，取一定量添加到無機鹽培養基中，使萘、菲、蒽、芘、芴的質量濃度分別為50 mg/L，待正己烷揮發完畢后備用。
在上述培養基中分別加入質量分數為2%的瓊脂，即得相應的固體培養基。
6010型紫外-可見分光光度計：惠普公司；全自動生長曲線分析系統，丹麥Biosense；GC-2010型氣相色譜儀：日本島津公司。GTR21-1型離心機：北京時代北利公司。
1.2萘降解菌的篩選
取10 g柴油污染土壤加入到100 mL無機鹽培養基中，于溫度30℃、轉速170 r/min條件下浸取4 h，將浸取液在3 000 r/min下離心5 min，將10 mL上清液加入到100 mL萘選擇性液體培養基中經4代富集培養（萘質量濃度從50 mg/L逐步提高到200 mg/L）后，取適量富集培養液，稀釋涂布在萘選擇性固體培養基平板上，待有明顯菌落出現時從中選取大小、形態各異的菌落在LB固體培養基上進行進一步劃線純化分離。
將各純化后的菌株分別接種于LB液體培養基中，于溫度30℃、轉速170 r/min條件下搖床培養20 h，培養液在轉速6 000 r/min下離心，用生理鹽水重懸浮并調節菌懸液在600 nm處的吸光度（OD600）為1，冷藏備用。
將各菌懸液按10%（φ）的接種量分別接種到萘選擇性液體培養基中，觀察其生長情況并測定培養液中的萘含量，實驗設置3組平行試樣。
1.3萘降解菌的鑒定
利用Baldwin等2003年報道的nah基因的簡并引物nahf/nahr，對篩選出的菌株進行PCR擴增實驗，用細菌DNA提取試劑盒（Tiangen）對菌株進行DNA提取。選擇一株生長情況最好、對萘降解能力最強且含有nah基因的菌株作為萘降解菌。
菌株的鑒定工作委托中美泰和生物技術（北京）有限公司完成。
1.4萘、菲、蒽、芘、芴的降解
將萘降解菌的菌懸液按10%（φ）的接種量分別接種于100 mL含不同PAHs的降解培養基中，于溫度30℃、轉速170 r/min條件下搖床培養，定時取樣，測定生長曲線及降解后培養液中各PAHs含量，實驗設置3組平行試樣。
1.5分析方法
1.5.1菌體濃度的測定
以菌體培養液的OD600值表征培養液中的菌體濃度。
1.5.2萘、菲、蒽、芘、芴質量濃度的測定
試樣經正己烷萃取后，用氣相色譜儀測定各PAHs的質量濃度。色譜條件：進樣口溫度300℃，檢測器溫度330℃，毛細管柱50 m×0.25 mm×0.25μm，柱溫130℃保持3 min，以15℃/min的升溫速率梯度升溫至280℃，進樣量1μL。
1.5.3脫氫酶活性的測定
通過測定微生物的脫氫酶活性可以了解微生物對有機污染物的氧化分解能力，具體方法：取2 mL降解后培養液于一系列具塞試管中，加入pH=8.5的0.05 mol/L Tris-HCl緩沖溶液、0.1 mol/L葡萄糖溶液、0.5%（w）TTC各2 mL，置于30℃恒溫培養箱中反應4 h。加入2滴濃硫酸中止反應，并準確加入5 mL甲苯，充分振蕩，萃取。待反應生成的紅色三苯基甲臜（TF）被完全萃取到有機相時，將有機相在4 000 r/min下離心5 min，過濾后測定濾液于486 nm處的吸光度（OD486），以此表征萘降解菌的脫氫酶活性。
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