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滸苔多糖降解微生物采集、分離、篩選、鑒定及生長曲線測定(二)

1.2滸苔多糖的提取


采取已建立的熱水浴加乙醇沉降的方法提取滸苔多糖,具體步驟為:將滸苔清洗干凈后,取適量于無菌水中,置于90℃水浴鍋水浴7 h,收集液體,重復(fù)操作2次。將所得液體離心(4 800g(g為重力加速度),15 min)去雜質(zhì)后濃縮至50 mL。加1/5提取液體積的氯仿正丁醇溶液(氯仿∶正丁醇=5∶1)劇烈震蕩30 min后離心,取水相,去除提取液中的蛋白質(zhì),重復(fù)3次至無白色沉淀,收集上清液。將收集的液體用3倍體積的無水乙醇沉降,離心去上清,待干燥后加入適量無菌雙蒸水溶解備用。


1.3滸苔多糖降解微生物的篩選


將提取的滸苔多糖以5 g/L的終濃度加入無碳的海洋無機鹽培養(yǎng)基(minimum marine medium,MMM)中,該培養(yǎng)基含有25.95 g NaCl,2 g MgCl2·6H2O,3 g MgSO4·7H2O,0.12 g CaCl2·2H2O,27 mL 0.5 mol/L Na2EDTA,25 mL 1 mol/L Tris-HCl(pH=8),10 mL 1 mol/L NH4Cl,0.8 g K2HPO4,0.2 g KH2PO4,0.015 g FeSO4·7H2O,0.03 g H4MoNa2O6,1 mL微量元素混合液(含H3BO3 2.86 g/L,MnCl2·4H2O 1.86 g/L,Zn SO4·7H2 O 0.22 g/L,Na2MoO4·2H2O 0.39 g/L,CuSO4·5H2O 0.08 g/L,Co(NO3)2·6H2O 0.05 g/L)和1 mL 1 000*維生素混合物。將分離到的菌株接種到以滸苔多糖為唯一碳源的MMM液體培養(yǎng)基中,28℃、200 r/min震蕩培養(yǎng),根據(jù)生長情況判斷各菌株對滸苔多糖的利用能力,篩選出能利用滸苔多糖的菌株。同時,按照BIOLOG使用方法,用PM2A碳源利用板測試幾株菌對PM2A板上各碳源的利用情況。


1.4滸苔多糖降解菌的生長曲線測定


為了測試篩選出的滸苔多糖降解菌株A1-6和S7對滸苔多糖的利用能力及對其他碳源的利用情況,用2216E液體培養(yǎng)基加上滸苔多糖及其他碳源測試菌株的生長曲線及碳源利用譜。除滸苔多糖外,測試的碳源有:葡萄糖、α-乳糖、D-果糖、D-麥芽糖、D-半乳糖、蔗糖、木聚糖、糊精、可溶性淀粉及明膠。配制以上各種糖的儲備液,質(zhì)量濃度為20 g/L。所用糖溶液經(jīng)121℃、15 min高溫蒸汽滅菌后使用。取保存的A1-6和S7菌種,用2216E液體培養(yǎng)基培養(yǎng),轉(zhuǎn)接3代活化。取15 mL無菌培養(yǎng)管,每管加入2216E培養(yǎng)基9 mL,待測糖儲備液1 mL(終質(zhì)量濃度為2 g/L),接種菌液1 mL。以不加糖儲備液的培養(yǎng)物作為對照。每組培養(yǎng)物各重復(fù)做3次。用丹麥Biosense微生物生長動態(tài)監(jiān)測系統(tǒng)掃描計算培養(yǎng)物在600 nm下的OD值


2結(jié)果分析


2.1采樣點滸苔綠潮的情況


2020年2月廣西北海爆發(fā)了滸苔綠潮。圖1(a)為廣西北海金海灣海域的綠藻,發(fā)現(xiàn)引發(fā)此次綠潮的綠藻主要有2種:絲狀的滸苔及片狀的滸苔。2021年7月,山東青島爆發(fā)了滸苔綠潮,圖1(b)為山東青島棧橋海域的綠藻,引發(fā)此次綠潮的綠藻主要為絲狀滸苔。

2.2北海及青島樣品分菌結(jié)果分析

北海樣品分離的微生物鑒定結(jié)果見表1。北海樣品中共分離到13種菌,其中海水樣品中有8種,絲狀滸苔附著菌分離到7種,片狀滸苔附著菌分離到4種(3個樣品中分離到的菌株存在部分重復(fù),如交替單胞菌Alteromonas macleodii和Alteromonas oceani在3個樣品中都分離到;Polaribacter marinaquae和Maribacter dokdonensis分別在2個樣品中都有分離到)。共分離到3種黃桿菌:Polaribacter marinaquae、Maribacter dokdonensis、Cellulophaga lytica。其中,在海水及片狀滸苔上有分離到Polaribacter marinaquae(片狀滸苔上4次都分離到),絲狀滸苔上沒有分離到Polaribacter marinaquae;在片狀滸苔上和絲狀滸苔上都有分離到Maribacter dokdonensis(絲狀滸苔上2次分離到),海水中沒有分離到Maribacter dokdonensis;只在絲狀滸苔上分離到1株Cellulophaga lytica。

青島樣品分離的微生物鑒定結(jié)果見表2。青島樣品中共分離到22種菌,其中海水樣品中有10種,絲狀滸苔附著菌分離到12種,共分離到4種黃桿菌:Meridianimaribacter flavus、Tenacibaculum geojense、Tenacibaculum mesophilum和Algibacter lectus,4株都是在絲狀滸苔上分離到的,海水中沒有分離到。對比2個采樣點的分菌結(jié)果,只有Alteromonas confluentis在北海和青島樣品中都有分離到。其他菌株均不相同,包括2個樣點分離到的黃桿菌也不相同。

在菌株鑒定的基礎(chǔ)上,對重點分析的5株菌:菌株A1-6、S7、A2-2、aA1-7和aA1-9構(gòu)建了基于16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育樹(見圖2)。從圖2可見,菌株A1-6與Alteromonas confluentis親緣關(guān)系最近,聚成一支,且屬于γ變形菌(γ-proteobacteria)。菌株S7、aA1-7、aA1-9、A2-2分別與Algibacter lectus、Cellulophaga lytica、Maribacter dokdonensis和Polaribacter marinaquae聚成一支,都隸屬于黃桿菌(Flavobateria)。


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